A maioria destes planos refere-se ao sul de Portugal, onde a escassez de água e a agricultura extensiva colocam desafios importantes ao ordenamento do território e à proteção dos recursos naturais. Ao plano para as albufeiras de Alqueva e Pedrógão, realizado em 2001 em colaboração com o consórcio FBO/Chiron, seguiram-se os de Enxoé em 2005, Odelouca, em 2007, Odeleite, em 2010 e Foz do Tua para a EDP, a decorrer desde 2013.
A elaboração destes planos especiais de ordenamento é determinada por legislação própria que preconiza o estabelecimento de regimes de salvaguarda dos recursos naturais, com especial destaque para os hídricos, que permitam a gestão da albufeira e da sua envolvente e assegurem a articulação entre as diferentes entidades competentes na área.
Os trabalhos incluem o levantamento da situação, os estudos de base, a pré-proposta de ordenamento, o projeto do Plano, com a proposta de ordenamento, a definição do zonamento, a regulamentação, o programa de execução e financiamento e o programa de monitorização da qualidade da água e, finalmente, a condução do processo de discussão pública.